MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.02

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019686	TAT	2	6	80	85	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740455
2	NC_019686	TGG	2	6	98	103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427740455
3	NC_019686	GAG	2	6	171	176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740455
4	NC_019686	GAA	2	6	179	184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740455
5	NC_019686	CAA	2	6	237	242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740455
6	NC_019686	TAA	2	6	248	253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740455
7	NC_019686	GGA	2	6	260	265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740455
8	NC_019686	AATG	2	8	288	295	50 %	25 %	25 %	0 %	427740455
9	NC_019686	AATT	2	8	322	329	50 %	50 %	0 %	0 %	427740455
10	NC_019686	AAGG	2	8	338	345	50 %	0 %	50 %	0 %	427740455
11	NC_019686	A	8	8	355	362	100 %	0 %	0 %	0 %	427740455
12	NC_019686	TAA	2	6	379	384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740455
13	NC_019686	TGA	2	6	407	412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740455
14	NC_019686	TAAAA	2	10	430	439	80 %	20 %	0 %	0 %	427740455
15	NC_019686	TTC	2	6	464	469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019686	TTG	2	6	481	486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019686	AT	3	6	499	504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019686	ATC	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019686	TG	3	6	585	590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019686	TA	3	6	593	598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019686	TAA	2	6	622	627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019686	T	7	7	781	787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019686	T	6	6	822	827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019686	GT	3	6	845	850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019686	CAG	3	9	853	861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019686	T	7	7	921	927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019686	ACCA	2	8	944	951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019686	TGC	2	6	988	993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019686	CGAA	2	8	1030	1037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019686	GCA	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019686	GGGGAA	2	12	1087	1098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019686	T	6	6	1128	1133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019686	T	7	7	1139	1145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019686	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019686	TAT	2	6	1271	1276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019686	TTTTGG	2	12	1277	1288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019686	TTG	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019686	TTA	2	6	1346	1351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019686	TTG	2	6	1394	1399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740456
40	NC_019686	AAT	3	9	1517	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019686	GAC	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019686	TGA	2	6	1631	1636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740457
43	NC_019686	T	6	6	1861	1866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019686	TA	3	6	1896	1901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019686	TGA	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019686	A	7	7	1942	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019686	T	6	6	2015	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019686	G	6	6	2031	2036	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019686	T	7	7	2044	2050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019686	ACCA	2	8	2063	2070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019686	TGAT	2	8	2089	2096	25 %	50 %	25 %	0 %	427740458
52	NC_019686	ACA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740458
53	NC_019686	GTTC	2	8	2217	2224	0 %	50 %	25 %	25 %	427740458
54	NC_019686	TGA	2	6	2243	2248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740458
55	NC_019686	ACC	2	6	2257	2262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740458
56	NC_019686	TGA	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740458
57	NC_019686	AGA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740458
58	NC_019686	TGTT	2	8	2471	2478	0 %	75 %	25 %	0 %	427740458
59	NC_019686	AGC	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740458
60	NC_019686	ATT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740458
61	NC_019686	GCA	2	6	2639	2644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740458
62	NC_019686	AGA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740458
63	NC_019686	CGT	2	6	2742	2747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740458
64	NC_019686	GT	3	6	2746	2751	0 %	50 %	50 %	0 %	427740458
65	NC_019686	T	6	6	2804	2809	0 %	100 %	0 %	0 %	427740458
66	NC_019686	GAT	3	9	2853	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740458
67	NC_019686	TGA	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740458
68	NC_019686	AAT	3	9	2940	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740458
69	NC_019686	CTC	2	6	2998	3003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740458
70	NC_019686	ACT	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740458
71	NC_019686	AAC	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740458
72	NC_019686	GTG	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427740458
73	NC_019686	TTTA	2	8	3057	3064	25 %	75 %	0 %	0 %	427740458
74	NC_019686	T	6	6	3089	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	427740458
75	NC_019686	ATTT	2	8	3097	3104	25 %	75 %	0 %	0 %	427740458
76	NC_019686	AATA	2	8	3108	3115	75 %	25 %	0 %	0 %	427740458
77	NC_019686	AGTTG	2	10	3152	3161	20 %	40 %	40 %	0 %	427740458
78	NC_019686	TAA	2	6	3185	3190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740458
79	NC_019686	AGC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740458
80	NC_019686	AAGG	2	8	3227	3234	50 %	0 %	50 %	0 %	427740458
81	NC_019686	ATG	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740458
82	NC_019686	TA	3	6	3293	3298	50 %	50 %	0 %	0 %	427740458
83	NC_019686	CTC	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740458
84	NC_019686	TAA	2	6	3350	3355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740458
85	NC_019686	AAT	2	6	3381	3386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740458
86	NC_019686	GTA	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740458
87	NC_019686	AGA	2	6	3404	3409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740458
88	NC_019686	ACA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.